10 марта 2021 года Есипенко задержали сотрудники ФСБ России по обвинению в сборе информации «в интересах украинских спецслужб» и хранении «самодельного взрывного устройства» в автомобиле. В 2022 году подконтрольный РФ суд в Крыму приговорил Есипенко к пяти годам лишения свободы и штрафу в размере 110 тысяч рублей. Российская прокуратура требовала для него 11 лет. Сам Есипенко на суде заявлял, что российские силовики его пытали, в том числе электрическим током, добиваясь признаний. За время заключения Есипенко стал лауреатом нескольких престижных наград: Free Media Award (2022), Freedom to Write Award от PEN America (2022), Национальной премии имени Игоря Лубченко, а также получил государственную стипендию имени Левка Лукьяненко, которая присуждается украинским политзаключенным.
